單門層析柜YC-1B標準的制冷系統由壓縮機、冷凝器、蒸發器、膨脹閥、電磁閥等組成。制冷系統時層析柜的關鍵。

用管道依次將這些設備連接，形成一個封閉式系統。系統工作時，壓縮機將蒸發器所產生的低溫低壓制冷劑蒸氣吸入汽缸內，經壓縮機壓縮，壓力升高(溫度也升高)到稍大于冷凝器內的壓力時，將其汽缸內的高壓制冷制蒸氣排到冷凝器中。(所以壓縮機起著壓縮與輸送制冷劑作用)在冷凝內高溫高壓的制冷劑蒸氣與溫度較低的空氣(或常溫水)進行熱交換而冷凝為液態制冷劑，這時液態制冷劑經過膨脹閥降溫(降壓)后入蒸發器，在蒸發器內吸收被冷卻物體的熱量后在汽化。這樣被冷卻物體便得到冷卻而制冷劑蒸氣又被壓縮機吸走，因此在制冷系統中經過壓縮、冷凝、膨脹、蒸發四個過程完成一個循環。